Une idée comme ça...

A tester ou pas...

Ta polyligne, tu la découpe pour faire 2 ou 3 morceaux.
Comme ce ne seront pas des solides "autochevauchants", ils pourront peut-être être unis de manière booléenne sans problème.
Ils se chevaucheront mais leur union supprimerait l'interieur en commun.

C'est une piste.

Non ?